Веселый работник у вас однако:) А на каком собственно основании вы платили за лизинг? И ПВН, наверное, выделяли? И износ начисляли?

Плохо дело. Мой вам совет, бегите к лизингодателю и слезно просите переоформить лизинг на фирму, т.е. как будто договор с самого начала был заключен с фирмой (правда, плохо себе представляю, как вам это удастся).

Если нет, то исправляйте все отчеты (ПВН, износ и т.д.) и опять же бегите к лизингодателю с просьбой перезаключить договор на фирму хотя бы с сегодняшнего дня. А потом какими-нибудь хитрыми договорами займа и зачета урегулируйте свои финансовые отношения с вашим удалым работником.

В противном случае даже страшно начинать считать сколько налогов вы и ваш работник недоплатили родному государству

Он не веселый, а расчетливый. Оформлять лизинг на фирму больше заморочек. Начинают требовать баланс, копию устава и прочую макулатуру. А для физического лица достаточно справки с места работы и паспорта.